Есть очень хорошая трилогия: "Апокалипсис", "Поиск. Dies Irae" и "Долг. Теория войны". В них полностью переделан сюжет, но очень грамотно и интересно. Можешь поискать их здесь:
http://stalker-gsc.ru/ или звони-пиши, привезу на флешке.
Недавно была завершена работа над глобальнейшим модом Lost World Troops Of Doom. Там кроме совершенно другого сюжета добавлено несколько новых локаций (но сам я в финальную версию пока не играл). Официальный саqт мода:
http://thezone.org.ua/
Что касается просто всяких "солянок", то, думаю, стоит обратить внимание на "Народную солянку":
http://www.amk-team.ru/forum/index.php?showforum=38