Мих, из ДКП следует, что ты купил именно то транспортное средство, которое собираешься ставить на учёт? Т.е. указаны ли там какие-то номера (ТС или агрегатов)? Одинаковые ли печати стоят на ПТС и в договоре?
Пути решения проблемы может быть два.
1. Едём в Ярославль, делаем надпись о выдаче ПТС (можно самому рукописную), заверяем её печатью продавца. Естественно, что печати в ДКП и в ПТС должны быть одинаковые. До печати-то реально добраться? Или проще привезти им заранее написанный договор по образцу
http://www.gai.net.ru/g03/g0317.html ....
2. Начинаем кляузничать. Мы - простые граждане - живём по ППРФ №938 от 12.08.1994, но упомянутые там Правила регистрации и учёта ТС как раз и утверждены Приложением №1 к злосчастному Приказу МВД РФ №59 от 27.01.2003. Т.е. если идти по гражданскому пути, нужно будет дойти до Конституционного суда, а если по служебному - до ГУ МВФ РФ. Ты готов на это?
В действиях районного РЭО, отказавшего тебе в регистрации, нарушения нет - не будут же они нарушать приказ своего министра. Кто же виноват, что и законы у нас пишут троешники?